Research

Trees have evolved to survive the harsh winters of the boreal forests, but deciduous trees and conifers have chosen different strategies; either to shed their leaves or to stay green over the winter. We are trying to understand the molecular details behind these strategies.
How do aspens know it is autumn?
We are learning how to identify the genetic differences that make trees different from each other. Forest trees are, in general, more genetically diverse than most other organisms and aspens are, in this respect, extreme. We have built many genomic resources for Populus in general and aspen (P. tremula) in particular, for example clone collections (the SwAsp and UmAsp collections), ESTs, genome sequences as well as bioinformatic tools and databases.

Using these tools, we study how aspens acclimate and adapt to the environment. Particular attention is paid to the process of phenology, in particular autumn senescence, trying to answer the question: How do trees know it is autumn? We are studying gene expression, photosynthesis and metabolism of the leaves during autumn senescence. In these studies, we use transgenic plants but, more importantly, natural variation. There is a steep cline in autumn senescence; trees from northern latitudes enter senescence much earlier than those from southern latitudes, and by using the aspen genome sequence, the collection of aspen clones and genetic tools like association mapping, we hope to understand the genetic basis of this important trait.

How can conifers stay green in the winter?
In the photosynthetic apparatus of green plants, the light- harvesting chlorophyll a/b-binding (LHC) proteins serve as antennae for photosystems I and II. Members of the LHC protein family have three membrane-spanning regions and bind the majority of the photosynthetic pigments (chlorophyll and carotenoids), make the photosynthetic light reaction efficient and regulate the photosynthetic light reaction, for example by dissipating excess light and adjusting the excitation balance between the photosystems. There are a group of proteins that are more distant members of this protein family. This group includes PsbS and ELIPs. PsbS is necessary for a light dissipation process – the qE type of non-photochemical quenching (NPQ) - that operates when the plants are exposed to "excess light".
We are now focusing on how the photosynthetic apparatus of conifers have been adapted to make it possible for conifers to keep their leaves (needles) green over the winter. We are using molecular biology, biochemistry, biophysics etc. to study conifers grown in the field, over the season. Have the conifers evolved specific molecular mechanisms that allow them to stay green in the winter, or do they employ the same mechanisms as other plants, but to a higher extent?
Key Publications
- Nystedt B, Street NR et al. (2013). The Norway spruce genome sequence gives insights into conifer genome evolution.Nature 497:579-584
- Tuskan GA, DiFazio S, Jansson S, et al. (2006). The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray) Science 313:1596-1604
- Sterky F, Bhalerao RR, Unneberg P, Segerman B, Nilsson P, Brunner AM, Campaa L, Jonsson Lindvall J, Tandre K, Strauss SH, Sundberg B, Gustafsson P, Uhlén M, Bhalerao RP, Nilsson O, Sandberg G, Karlsson J, Lundeberg J, Jansson S (2004). A Populus EST resource for plant functional genomics. PNAS 101 13951–13956
- Külheim C, Ågren J, Jansson S (2002). Rapid regulation of light harvesting is crucial for plant fitness in the field. Science 297:91-93
- Li, X-P, Björkman, O, Shih C, Grossman, AR, Rosenquist, M, Jansson, S, Niyogi, KK (2000). A pigment binding protein essential for regulation of photosynthetic light harvesting. Nature 40: 391-395
Team
- 2002: Professor, Umeå University
- 2001: Associate professor Umeå University
- 1996: Docent, Umeå University
- 1995: Assistant professor Umeå University
- 1992: PhD, Umeå University
- 2017: ”ÅForsks Kunskapspris”
- Since 2017: Fellow of the Royal Academy Sweden of Engineering Sciences (IVA)
- 2016-2018: President of The Federation of European Societies of Plant Biology
- 2016: Forest Biotechnologist Of The Year
- 2015-2019: President of Scandiavian Plant Physiology Society
- 2015: SPPS Popularization prize
- 2015: ”Baltics samverkanspris med populärvetenskaplig inriktning”
- 2014: Fellow of Kungl. Skytteanska samfundet
- 2014: Fellow of the Royal Sweden Academy of Science (KVA)
- 2013: Roséns Linne award, Kungl Fysiografiska Sällskapet
- Joseph Knevel & Bo Torbjörn Ek (2019). Kampen om Jorden: GMO-strid och framtid. Interview in Radio Sweden P1 Special 21/11 2019. https://sverigesradio.se/avsnitt/1392646
- Jansson S (2019). Jag vill genmodifiera din mat. Guest in Fråga vad du vill i P3, Radio Sweden. https://sverigesradio.se/sida/avsnitt/1312023?programid=4977
- Genmodifierad mat kan bli livsavgörande. Interview in TV4 Nyheter 27/8 2019. https://www.tv4.se/nyheterna/klipp/genmodifierad-mat-kan-bli-livsavg%C3%B6rande-12495481
- Marie Barse (2018). Kan GMO redde verden? Interview in Videnskap 2/5 2018. https://videnskab.dk/teknologi-innovation/kan-gmo-redde-verden
- Jansson S, von Bothmer R, Fagerström T (2018). Forskare: Kan MP kliva över till vetenskapens sida? SvD Brännpunkt 30/12 2018. https://www.svd.se/kan-mp-kliva-over-till-vetenskapens-sida/i/senaste/om/debatt
- Jansson S (2017). Lövin gör som SD – blundar för fakta. Aftonbladet Debatt 17/1 2017. https://www.aftonbladet.se/debatt/a/3Gm0P/lovin-gor-som-sd--blundar-for-fakta
- Jansson S (2016). Greenpeace har gått vilse i GMO-debatten. Dagens ETC 21/8 2016. http://www.etc.se/debatt/greenpeace-har-gatt-vilse-i-gmo-debatten
- Jansson S, Fossdal C-G (2016). Norge et land av «GMO-talibanere» som undergraver vitenskapelig ervervet kunnskap og erkjennelse. Dagbladet 24/10 2016. http://www.dagbladet.no/kultur/norge-et-land-av-gmo-talibanere-som-undergraver-vitenskapelig-ervervet-kunnskap-og-erkjennelse/64015658
- Satsning för att öka kunskapen om GMO. Vetenskapsradions veckomagasin 24/4 2015 http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=415&artikel=6150367
- Jansson S, Liberg O (2014). Gröna politiker måste tåla grön granskning. SvD Brännpunkt 2/7 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/grona-politiker-maste-tala-gron-granskning_3711156.svd
- Jansson S (2014). Ett maktskifte kan slå vår forskning i spillror. SvD Brännpunkt 12/7 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/ett-maktskifte-kan-sla-var-forskning-i-spillror_3741400.svd
- Jansson S (2014). MP och V bromsar utvecklingen av miljövänlig teknik. DN Debatt 28/4 2014. http://www.dn.se/debatt/mp-och-v-bromsar-utvecklingen-av-miljovanlig-teknik/
- Fjellner C, Jacobsson K, Jansson S, Lövin I, Widebäck C (2014), live debate in Radio Sweden P1 Vetandet värld 20/5 2014. https://sverigesradio.se/avsnitt/371949
- Jansson S (2014). Debatt: Är LRF redo att bejaka GMO? (2014) Land lantbruk 2014:2. http://www.lantbruk.com/debatt/replik-ar-lrf-moget-att-bejaka-gmo
- Jansson S (2014). Vilseledande argument mot genmodifiering. SvD Brännpunkt 4/3 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/vilseledande-argument-mot-genmodifiering_3327482.svd
- Busenkelt att göra en genförändrad växt. Radio Sweden Vetenskapsradion 4/6 2013. http://sverigesradio.se/sida/avsnitt/202748?programid=412
- Jansson S, et al. (2011). Kvasivetenskap hindrar ett hållbart jord- och skogsbruk. DN Debatt 1/10 2011. http://www.dn.se/debatt/kvasivetenskap-hindrar-ett-hallbart-jord-och-skogsbruk/
- Jansson S (2011). Forskare och miljöaktivister på olika planeter? Radio Sweden Vetenskapsradion Klotet. 14/9 2011. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=3345&artikel=4696088
- Jansson S (2011). GMO-reglerna hämmar grön utveckling. Radio Sweden Dagens Eko 1/10 2011. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=83&artikel=4724699
- Jansson S (2019). Ekologisk odling är ofta en klimatbov. Expressen 2/2 2019. https://www.expressen.se/debatt/ni-influencers-borde-lyssna-pa-oss-forskare/
- Jansson S (2014). Ekologisk odling har blivit bakbunden. SvD Brännpunkt 20/11 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/ekologisk-odling-har-blivit-bakbunden_4121539.svd
- Gensaxen som förändrar världen. SVT Vetenskapens värld 7/12 2020. https://www.svtplay.se/video/29350256/vetenskapens-varld/vetenskapens-varld-sasong-33-nobelpristagarna-2020?position=1765&id=e4zWnox
- Dennis Eriksson, Mariette Andersson, Erik Andreasson, Per Hofvander, Stefan Jansson, Anders Nilsson, Paul Tenning, Li-Hua Zhu, Annika Åhnberg (2020). Låt kraften i gensaxen förbättra våra grödor. SvD 17/10 2020. https://www.svd.se/lat-kraften-i-gensaxen-forbattra-vara-grodor
- Erin Brodwin (2019). We´ll be eating the first crispr’d foods within 5 years according to a geneticicts who helped invented the block-buster gene-editing tool. Interview in Business Insider 20/4 2019. https://nordic.businessinsider.com/first-crispr-food-5-years-berkeley-scientist-inventor-2019-4
- Salvador Nogueira (2018). Europa sabota edicao genetica de precisao na agricultura diz cientista. Interview in Folha de S.Paulo. 29/10 2018. https://www1.folha.uol.com.br/ciencia/2018/10/europa-sabota-edicao-genetica-de-precisao-na-agricultura-diz-cientista.shtml
- Ewen Callaway (2018). CRISPR plants now subject to tough GM laws in European Union. Interview in Nature 25/7 2018. https://www.nature.com/articles/d41586-018-05814-6
- EU-domstolen om Crispr-modifierade växter: Ska klassas som GMO. Interview in Dagens Nyheter 25/7 2018. https://www.dn.se/nyheter/eu-domstolen-om-crispr-modifierade-vaxter-ska-klassas-som-gmo/
- Kai Kupferschmidt (2018). EU verdict on CRISPR crops dismays scientists. Interview in Science 3/8 2018. http://science.sciencemag.org.proxy.ub.umu.se/content/361/6401/435
- Éanna Kelly (2018). Scientists urge new EU rules on gene editing crops. Interview in Science Business 20/9 2018. https://sciencebusiness.net/news/scientists-urge-new-eu-rules-gene-editing-crops
- Maarten Rabaey (2018). Ligt er straks mutagenese op uw bord? Interview in De Morgen 24/7 2018. https://www.demorgen.be/wetenschap/eten-we-straks-gemuteerde-maaltijden-of-niet-be1585f2/
- Erin Brodwin (2018). A blockbuster gene-editing tool just got one step closer to overtaking GMOs. Interview in Business Insider 2/4 2018. http://www.businessinsider.com/crispr-gene-editing-tool-food-usda-regulation-2018-4?r=US&IR=T&IR=T
- Ellen Ø Andersen och Lars Foghsgaard (2018). Genredigerede planter stormer frem og udfordrer regler. Interview in Politikken 2/4 2018. https://politiken.dk/viden/Viden/art6412015/Genredigerede-planter-stormer-frem-og-udfordrer-reglerne
- Erin Brodwin (2018). A controversial technology could save us from starvation — if we let it. Interview in Business Insider 12/4 2018. http://www.businessinsider.com/crispr-genetic-modification-agriculture-food-2018-4
- Tekniken kan förbättra världens matproduktion. Interview in Dagens Nyheter 19/9 2017. https://www.dn.se/nyheter/sverige/tekniken-kan-forbattra-varldens-matproduktion/.
- Ontwerp je wereld. Interiew in TV-series “Van DNA to Z” 13/9 2017 NTR (Dutch public TV). https://www.dekennisvannu.nl/site/special/Van-DNA-tot-Z/102#!/artikel/Ontwerp-je-wereld/9210
- MUTANT MENU - The Ethics of Gene Editing. PBS dokumentär om genomeditering. https://www.youtube.com/watch?v=NrDM6Ic2xMM&list=PLLrbE8yAiTRS_IR7ZN1bV-uZDYIUWah9q
- Gentech oder nicht – eine Grenze verschwimmt. Interview in SRF Wissenshaftsmagazin 4/3 2017. http://m.srf.ch/sendungen/wissenschaftsmagazin/gentech-oder-nicht-eine-grenze-verschwimmt
- Och så skapade vi perfekta varelser. Interview in Fokus 17/3 2017. https://www.fokus.se/2017/03/och-sa-skapade-vi-perfekta-varelser/
- Die gute Seite der Gentechnik. Interview in Süddeutsche Zeitung 24/3 2017. https://www.sueddeutsche.de/wissen/samstagsessay-an-die-gruene-substanz-1.3434739!amp
- Neue Pflanzen. Interview in Süddeutsche Zeitung 20/1 2017. http://www.sueddeutsche.de/wissen/gentechnik-neue-pflanzen-1.3339704
- Selected links related to CRISPR/Cas9-edited cabbage cultivation in 2016: http://www.svt.se/nyheter/lokalt/vasterbotten/genklippt-kal-i-professors-tradgard
http://www.tv4.se/nyheterna/klipp/han-odlar-gmo-p%C3%A5-tomten-3536035
http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=406&artikel=6508845
http://www.theatlantic.com/health/archive/2016/09/gmo-food-crispr-cabbage/500528/
http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-3775885/Is-meal-future-Scientists-create-world-s-gene-edited-dinner.html
http://derstandard.at/2000044151489/Forscher-verspeiste-erstmals-Crispr-Pflanze
http://diepresse.com/home/science/5082390/Die-neue-Gentechnik-bittet-zu-Tisch
https://www.deingenieur.nl/artikel/eerste-maaltijd-met-door-genbewerking-aangepaste-groente - Jansson S (2016). To be or not to be a GMO, that is the question. Presentation at TEDx Umeå 11/5 2016 https://www.youtube.com/watch?v=kyrsNa1jLpo-
- Jennie Aquilonius (2019). Växter som väcker känslor. Interview/portrait in Universitetsläraren 27/5 2019. https://universitetslararen.se/2019/05/27/vaxter-som-vacker-kanslor/
- Jansson S (2019). Bort med etiketten, Norrmejerier. Västerbottenskuriren 18/7 2019. https://www.vk.se/2019-07-18/debatt-bort-med-etiketten-norrmejerier
- Jansson S (2018). Lobbyismen segrade över vetenskapen. DN Debatt 28/7 2018. https://www.dn.se/debatt/repliker/lobbyismen-segrade-over-vetenskapen/
- Jansson S, von Bothmer R, Fagerström T, Hansson GK, Larhammar D (2018). Hur länge ska Svanen få strunta i vetenskapen? SvD Debatt 20/2 2018. https://www.svd.se/hur-lange-ska-svanen-fa-strunta-i-vetenskapen
- Jansson S (2017). Regeringen bör ta Svanen i örat. SvD Näringsliv Debatt 4/12. https://www.svd.se/regeringen-bor-ta-svanen-i-orat
- Jansson S (2017). Svanen är fel ute när genteknik ses som hot. SvD Näringsliv Debatt 20/11 2017. https://www.svd.se/fondmarkning-gar-emot-vetenskaplig-konsensus
- Jansson S (2016). En bättre värld. Sommarforskarpodd, Radio Science 2/9 2016. http://www.radioscience.se/sommarforskare/38-en-battre-varld/
- Alexanderson E, Bülow L, Jansson S, Strand Å, Sundberg E, Sundström J (2014). Tro får inte ersätta vetenskap. SvD Brännpunkt 16/12 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/tro-far-inte-ersatta-vetenskap_4191205.svd
- Jansson S, Liberg O (2014). Gröna politiker måste tåla grön granskning. SvD Brännpunkt 2/7 2014. http://www.svd.se/opinion/brannpunkt/grona-politiker-maste-tala-gron-granskning_3711156.svd
- Fredagsgäst Radio Sweden P4 Västerbotten 26/4 2013. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=284&artikel=5517264
- Federoff N, Zeigler RS, Fagerström T, Jansson S, Stymne S, Sundström J (2013). Ska SIDA sabotera matforskning? UNT Debatt 22/20 2013. http://www.unt.se/asikt/debatt/ska-sida-sabotera-matforskning-2655302.aspx
- Jansson S (2014). Forskare i fokus för medierna. Vetenskap & Allmänhets, VRs, Formas, Vinnovas et al. medieseminarium, Umeå University 11/3 2014. https://www.youtube.com/watch?v=ToJabAUvBIA&feature=youtu.be
- Jansson S (2013). Presentation "Forskare i fokus för medierna" and participation in panel debate Vetenskap & Allmänhets, VRs, Formas, Vinnovas et al. medieseminarium, Karolinska institutet 26/8 2013. https://www.youtube.com/watch?v=isjGo0Lhljg&list=TLhrCgcnkok98bK_nHs8bUxalKuLFjNuI0; http://www.akademiliv.se/2013/09/13490/
- Kerstbomen blijven groen in de winter dankzij fotosynthese shortcut. Interview in BNR 24/12 2020. https://www.bnr.nl/podcast/wetenschap-vandaag/10428954/kerstbomen-blijven-groen-in-de-winter-dankzij-fotosynthese-shortcut
- Jansson S (2020). Vad får asplöven att bli gula och varför är barren fortfarande gröna? Interview in Radio Sweden P1 Naturmorgon 26/9 2020 https://sverigesradio.se/artikel/7562058
- Anke Fossgreen (2020). Wie Bäume ihr Testament Machen. Interview in Der Bund 14/11 2020 https://www.derbund.ch/wie-baeume-ihr-testament-machen-446175800919
- Jansson S (2019). Hur kommunicerar träd? - Trädprofessorn Stefan Jansson. Guest in Morgonpasset i P3 19/3 2019, Radio Sweden. https://sverigesradio.se/sida/avsnitt/1271073?programid=4765
- Gerhard Stenlund (2018). Varm sommar färgar av sig på hösten. Interview in P1 Morgon Radio Sweden 3/10 2018. https://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=1650&artikel=7058200
- Elin Viksten (2018). Mysteriet med höstlöven kvar att lösa. Interview in Extrakt 2/10 2018. http://www.extrakt.se/skogsfragor/mysteriet-med-hostloven-kvar-att-losa/
- Vädret styr höstens färger. Interview in SVT Gävleborg 19/10 2018. https://www.svt.se/nyheter/lokalt/gavleborg/vadret-styr-hostens-farger
- Jansson S (2017). Hur vet egentligen trädet att det är host? UR Samtiden 9/3 2017 https://www.upsc.se/about-upsc/downloads/videos/5200-media-a-downloads-3.html
- Varför fängslar höstfärgerna? Interview in Radio Sweden Godmorgon Världen 24/9 2017. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=438&artikel=6782591
- Jansson S (2014). Hur vet trädet att det är höst? SVT UR Samtiden/Kunskapskanalen. http://www.ur.se/Produkter/181975-UR-Samtiden-Hur-vet-tradet-att-det-ar-host
- Jansson S (2014). Hur vet trädet att det är höst? Forskartorget Umeå Centrum 6/12 2014. https://www.youtube.com/watch?v=Bncb_fcWLhs
- Granens arvsmassa kartlagd. SVT Rapport 23/5 2013. http://www.svt.se/nyheter/vetenskap/granens-arvsmassa-kartlagd
- Granens arvsmassa kartläggs. Interview Radio Sweden Västerbotten 4/1 2010. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=109&artikel=3348760
- Jansson S (2011). Granen valdes av en slump. Radio Sweden Jämtland 26/11 2011. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=78&artikel=4205593
- Granens arvsmassa kartlagd. Radio Sweden Vetenskapsradion 23/5 2013. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=406&artikel=5542142
- Vilket träd är du? Interview in Radio Sweden Västerbotten 23/5 2013 http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=109&artikel=5542907
- Jansson S (2014). Granar rules the world. Institutet Radio Sweden P3 http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=4131&artikel=6048170
- Aspar mer olika än människor. Interview in Radio Sweden Vetenskapsradion 7/5 2008. http://sverigesradio.se/sida/artikel.aspx?programid=406&artikel=2055811
- Kemi knäckte grankoden. Interview in Ny Teknik, 5/6 2013. http://www.nyteknik.se/nyheter/innovation/forskning_utveckling/article3703493.ece
CV S. Jansson
Academic degrees and employments
Special awards and Honours
Public outreach
Stefan Jansson has participated in a wide range of popular science activities. Please find an overview about his activities here:
Publications
doi link bibtex abstract
doi link bibtex abstract
Svenska

Vi försöker begripa hur man bäst listar ut vilka gener som gör aspar olika. Vi skapar olika verktyg för detta, t ex DNA microarrays, kollektioner av olika aspar samt olika databaser. Vi använder dessa för att förstå hur aspar anpassar sig till omgivningen, framför allt studerar vi hur en asp vet att det är host, varför, hur och när höstfärgerna uppstår och vad det är som gör att olika aspar har olika “tidtabell” under hösten.
I ett annat projekt studerar vi hur växternas fotosyntesapparat fångar in solljuset, och hur växten reglerar detta för att undvika att för mycket ljusenergi går in i fotosyntesen, för att undvika skador som i värsta fall kan leda till döden. Ljuset fångas in av en grupp proteiner, LHC proteinerna, och vi försöker förstå den exakta funktionen av dessa proteiner. Ett protein, PsbS, är speciellt viktig för att reglera denna process och vi studerar PsbS betydelse för växten.